南通航运职业技术学院是一所专科层次的交通类高等职业学校，是经江苏省人民政府批准，2000年10月在江苏省南通航运学校的基础上改制升格而成。隶属于江苏省交通厅。现为亚太海事教育与培训协会会员。 学院的前身江苏省南通航运学校创建于1960年，已经历了四十年的发展历程，现已为交通运输事业输送毕业生9011名，各类短期培训学员2万多名。
学院办学规模为6000人，设有航海系、轮机工程系、船舶工程系、交通工程系、管理信息系、机电系、人文艺术系等七个系25个专业。主要专业有：海洋船舶驾驶、海洋船舶轮机管理、国际运输管理、国际商务、现代物流管理、交通工程设备及自动化、现代物流设备与计算机辅助设计、现代汽车技术、信息与网络技术、机电一体化、船舶机电工程、数控技术应用、商贸英语等，分为初中后五年制、中专后二年制、高中后三年制等种形式。
其中“海洋船舶驾驶”、“海洋船舶轮机管理”、“现代汽车技术”为主干专业。学院全日制普通高等教育以高中后三年制专科为主，成人高等教育有函授和夜大两种形式，现有全日制普通教育学生9000多人，成人学历教育学员近500人。 学校现在位于南通市经济技术开发区通盛大道185号。
2002年9月，江苏省发展计划委员会批复，同意学院在南通市经济技术开发区内征地800亩，按8000人的规模进行新校区建设，项目总建筑面积约15。5万平方米（不含后勤用房）,总投资2。76亿元。学院现有教职员工275人,其中专任教师175人。 高、中级职务教师分别占专任教师数的23%和43%。
学院承担着《交通职业教育》、《江苏港口》两个学术期刊的编辑出版任务。学院学报经国家新闻出版总署批准，具有国内外公开发行的资格。 学院具备一流的教学设备和教育质量。建有各类实验室35个，开发研制了多种航海、轮机模拟器，部分设备具有国内领先水平或达到国际水平。
学生在校学习期间可获得多项技能证书，航海专业毕业生具有的职业证书和技能证书符合国际公约的要求，为国际海事组织所认可。毕业生深受社会用人单位的欢迎，一次性就业率保持在较高水平。 学院具有一流的职业培训条件。设有“江苏省海员培训中心”、“中国海事服务中心南通培训基地”、“南通现代汽车技术培训中心”及国家职业技能鉴定所。
经中华人民共和国海事局批准，航海专业具有熟悉和基本安全、精通救生艇筏和救助艇、高级消防、船上医护、精通急救、雷达观测与雷达模拟器、自动雷达标绘、GMDSS通用操作员、精通船电业务、高速船船员特殊培训、大型操船模拟器等11个项目的专项培训和特殊培训资格，并能举办甲类三副、三管轮与乙、丙类船长、轮机长、大副、大管轮适任证书考前培训，以及海员劳务外派岗前培训、英语强化培训和计算机在船舶中的应用等适用性、综合性的船员素质培训。
现已形成了多层次、多类型、多规格的培训体系。 学院在“两个文明”建设中取得了丰硕成果。先后被评为南通市文明单位、市花园式单位、市安全文明校园、省交通系统文明单位、省群众体育先进单位、省国防教育先进单位、省德育先进学校、省文明校园、省安全文明校园、全国“军民共建社会主义精神文明先进单位”。
学院秉承“自勉自奋、祈通中西”的校训，坚持质量立校、人才强校、特色兴校的发展战略，坚持以服务为宗旨、以就业为导向，走产学研相结合的发展道路，不断活化办学机制，努力培养高质量、高技能的应用型、开放型、创新型人才，毕业生就业率保持在98%以上，被评为省毕业生就业工作先进集体。
在新的征途中，全院师生正豪情满怀，努力开拓，以更高、更强、更优为目标，以建设一流的品牌学院，培养一流的毕业生为方向，以加快发展为主题，以深化改革为动力，以素质教育为主线，以全面提高教育质量为中心，努力造就思想品德好、业务知识新、实践能力强的创新人才、适用人才，为建设示范性的高等职业技术学院而奋斗。
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