入职协议的这个约定不符合法律规定，没有法律效力。
请看《劳动合同法》第26条规定，如果用人单位按旷工扣款，显然是免除用人单位依法支付劳动者劳动报酬义务，排除劳动者依法获得劳动报酬权利的条款，所以是无效的。
再看《对〈工资支付暂行规定〉有关问题的补充规定》可知，什么是克扣工资，而你说的这样肯定是属于克扣工资的行为。所以是不可行的。
如果没有签订劳动合同，劳动者可心随时走人，建议用人单位根据《工资支付暂行规定》第9条付清劳动者工资，避免劳动者根据《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第3条或《劳动合同法》第85条规定要求补偿或赔偿。
如果用人单位与劳动者签订了劳动合同，且没有《劳动合同法》第38条规定之情形，用人单位可以按第90条规定要求劳动者赔偿因违法解除劳动合同给用人单位造成的损失。
劳动者赔偿责任的构成要件包括三点，一是有违法行为或者违约行为，即存在劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密事项或者竞业限制的行为;二是损害事实，即劳动者的违法或者违约行为给用人单位造成损失。
三是损害事实与违法或者违约行为之间的因果关系，即劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密事项或者竞业限制的行为和用人单位的损失之间具有因果关系。三者缺一不可。
如果用人单位与劳动者签订了劳动合同，但用人单位有《劳动合同法》第38条规定之情形，劳动者可以随时走人，且根据《劳动合同法实施条例》第26条规定，无需承担违约责任，违约责任都免了，所以更谈不上赔偿了。
我说了这么多，你应该知道该怎么办了吧。
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