香菇菌种的遗传稳定性是相对的，遗传的变异性是绝对的。 菌种发生某些性状向坏的方向变异，称为菌种“退化”。菌种 “退化”有遗传造成的原因，有环境造成的原因。常见的香菇菌 种“退化”现象如菌盖变小、菌肉变薄、菌柄变长、出菇期推 迟、出菇潮数少、抗逆性差等。
但香菇菌种“退化”的机理总体 尚不清楚。 根据数十年的香菇菌种保藏的经验教训，本人认为防止“退 化”并无妙手回春的好办法，只有在菌种保藏和使用过程中多加 小心。 (1)保藏香菇菌种的条件要稳定、干净。菌种保藏的专用设 备不可将保藏条件悬殊过大的种类一起保藏，如香菇与草菇、茯 苓等不可在同一条件的容器内保存；容器内必须干净，温度必须 稳定，不随便开启，尽量少打开保藏菌种容器。
(2)变更培养基保藏，如PDA与木屑培养基同时使用，繁 殖时同时比较，选择使用。 (3)每年进行一次实验室常规性状测试比较，变异较大的菌 株停止使用，更换培养基后可恢复性状的可继续使用。 (4)有条件的应成批放入液氮罐保存，每年取出一支或数支 试管进行繁殖，恢复繁殖时按常规进行必要性能测试。
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