企业应该按照以下步骤申请知识产权管理体系认证：
1.了解认证标准和要求：企业需要了解知识产权管理体系认证的相关标准和要求，包括认证范围、认证流程、审核标准等。这有助于企业明确认证目标和方向，为后续的申请工作做好准备。
2.组织内部评估：企业需要对自身的知识产权管理状况进行多方面评估，包括知识产权的创造、运用、管理和保护等方面。通过评估，企业可以发现自身存在的问题和薄弱环节，为制定改进方案提供依据。
3.建立知识产权管理体系：企业需要按照认证标准的要求，建立完善的知识产权管理体系，包括制定知识产权政策、目标、管理制度、流程等。同时，企业需要确保体系的有效运行，并持续改进和优化。
4.准备申请材料：企业需要准备申请认证所需的材料，包括知识产权管理体系文件、运行记录、内部审核和管理评审报告等。这些材料应真实、完整地反映企业的知识产权管理状况和运行效果。
5.选择认证机构并提交申请：企业需要选择符合要求的认证机构，并提交认证申请。在提交申请前，企业需要与认证机构进行充分沟通，明确审核范围和要求，确保审核的顺利进行。
6.配合审核和认证：企业需要积极配合认证机构的审核工作，包括接受现场审核、提供必要的支持和证据等。同时，企业需要认真对待审核中发现的问题和不符合项，及时进行整改和改进。后面，企业需要获得认证机构的认证证书，以证明其知识产权管理体系符合标准要求。
在申请知识产权管理体系认证过程中，企业需要注意以下几点：
1.确保申请材料的真实性和完整性；
2.加强内部沟通和协作，确保各部门和人员的配合；
3.重视员工的知识产权培训和教育，提高员工的知识产权意识和能力；
4.认真对待审核中发现的问题和不符合项，及时进行整改和改进；
5.持续关注知识产权管理体系的运行效果，确保体系的持续改进和优化。